1. Bayern Munich (2012 – 2014)
Hojbjerg pindah ke Bayern pada Juli 2012 dan melakukan debut profesionalnya di Bundesliga pada 13 April 2013.
Pada bulan Desember tahun yang sama, ia menjadi bagian dari skuad Bayern yang memenangkan Piala Dunia Antarklub FIFA 2013 di Maroko, tetapi tidak bermain selama turnamen tersebut.
Pada tanggal 7 Januari 2015, Hojbjerg dipinjamkan ke sesama tim Bundesliga FC Augsburg untuk sisa musim 2014/15.
Dia melakukan debutnya pada 1 Februari 2015 melawan 1899 Hoffenheim.
Hojbjerg mencetak gol pertamanya di Bundesliga pada 11 April, saat kalah 2-1 melawan SC Paderborn 07.
Dia menyelesaikan masa pinjamannya dengan 16 penampilan Bundesliga dan dua gol.
Pada tanggal 28 Agustus 2015, Hojbjerg bergabung dengan Schalke 04 di Bundesliga dengan status pinjaman selama satu musim, membuat 30 penampilan untuk klub.
BACA JUGA:Al-Ittihad Tawarkan Gaji Besar, Namun Matias Soule Menolak Hanya Demi Ini
2. Southampton (2016 – 2020)
Pada 11 Juli 2016, Hojbjerg bergabung dengan klub Inggris Southampton dengan kontrak lima tahun dengan perkiraan biaya transfer sebesar £12,8 juta.
Dia melakukan debutnya di Liga Premier pada 13 Agustus dengan hasil imbang 1-1 melawan Watford.
Hojbjerg mencetak gol pertamanya untuk Saints pada 18 Maret 2018, dalam pertandingannya yang ke-54, di putaran keenam Piala FA, pertandingan pertama di bawah manajer baru Mark Hughes.
BACA JUGA:Xavi Hernandez Umumkan Akan Tinggalkan Barca di Akhir Musim, Begini Respon Fans Blaugrana
3. Tottenham Hotspur (2020 – sekarang)