Serai juga bisa diserang hama dan penyakit, walaupun pada dasarnya tanaman ini tahan terhadap hama.
Beberapa hama dan penyakit yang sering menyerang tanaman serai seperti kutu daun dan serangga belalang.
Tanaman ini bisa juga diserang penyakit layu, antraknosa dan busuk pangkal batang. Jadi harus rutin diawasi dan melakukan pengendalian jika ada tanda-tanda terserang hama dan penyakit.