Sistem operasi HyperOS 3 berbasis Android 16 juga membawa fitur keamanan tambahan berupa sandboxing aplikasi, pembaruan keamanan rutin, serta kontrol privasi yang memungkinkan pengguna mengatur izin akses kamera, mikrofon, dan lokasi dengan lebih detail.
Ponsel ini juga mendukung Secure Payment Mode, yang memastikan transaksi online berjalan aman dengan verifikasi ganda. Ditambah lagi, ada proteksi anti-malware bawaan yang aktif memantau aplikasi berbahaya dan mencegah akses tidak sah.